The Widow Son in the Windshield
首集剧情讲述Brennan和Booth发现了一个头骨，上面留有人类啃啮造成的痕迹，这些资料引领二人到一个秘密食人教派……与此同时，Zack的离去令Brennan和她的小组成员需努力去适应这个新的工作环境。
识骨寻踪第三季第2集剧情介绍Soccer mom in the Mini-Van
一辆小型客货车在公路旁暂停位置爆炸，驾车的是一名住在郊外的妇人，Booth从车牌资料中找到车主Jeremy，似乎死者就是他的妻子。当时车内还有皮箧和一些记念品，Jeremy的太太是否离家出走?不过，Jeremy却说她只是去探访他们在大学念书的女儿，事实究竟如何?
识骨寻踪第三季剧照
另一方面，Brennan到狱中探望父亲Max，不过二人关系仍然紧张。Max和Brennan道歉，但Brennan怀疑他只想博取Brennan为他出庭作证……
识骨寻踪第三季第3集剧情介绍Death in the saddle
一具男人残骸在丛林里被发现，双脚被斩，双手受绑，小组接手调查，验屍得出的线索把Brennan和 Booth带到一处提供性虐待服务的小屋……。Angela尝试用催眠的方法去找出她那神神秘秘的丈夫的真正名字，以便跟他离婚。
识骨寻踪第三季第4集剧情介绍The secret in the soil
Booth和Brennan新的治疗师Lance Sweets年方廿二，却打算评估两人，看他们是否适合继续结为工作搭挡，还是该拆夥;需要二人需要回家进行测试。
与此同时，一具屍体在已空置的医院内发现，而从屍体的腐烂程度来看，似乎屍身早在数星期前开始腐烂，可是屍身还是暖和的，而体内的温度更高达摄氏52度，原来屍体是被烹煮过!Angela鉴定後证实了死者是售卖有机食物的连锁超级市场东主Franklin Curtis
而Hodgins更在死者的裤子上发现杀虫剂，可是，这中年东主是致力於售卖有机食品的，他又怎会沾上杀虫剂这类化学物呢，到底箇中原因是甚麼?
